应该分别核算。按规定增值税和缴纳营业税。即：3000万缴纳营业税，6000万缴纳增值税。 增值税条例实施细则第六条规定，“纳税人的下列混合销售行为，应当分别核算货物的销售额和非增值税应税劳务的营业额，并根据其销售货物的销售额计算缴纳增值税，非增值税应税劳务的营业额不缴纳增值税；未分别核算的，由主管税务机关核定其货物的销售额：（一）销售自产货物并同时提供建筑业劳务的行为；（二）财政部、国家税务总局规定的其他情形”。 营业税条例实施细则第七条规定，“纳税人的下列混合销售行为，应当分别核算应税劳务的营业额和货物的销售额，其应税劳务的营业额缴纳营业税，货物销售额不缴纳营业税；未分别核算的，由主管税务机关核定其应税劳务的营业额：（一）提供建筑业劳务的同时销售自产货物的行为；（二）财政部、国家税务总局规定的其他情形”。
建筑施工企业一般交哪些税？税率多少？
建筑行业具体需要交以下税费：a、增值税；b、城市维护建设税；c、教育费附加、地方教育附加；d、印花税；e、企业所得税；f、房产税；g、个人所得税；h、土地使用税等。适用税率：a、增值税：一般纳税人适用11%的税率，小规模纳税人适用3%的征收率b、城市维护建设税：按实际缴纳的增值税税额计算缴纳。适用税率分别为7%（城区）、5%（郊区）、1%（农村）。c、教育费附加、地方教育附加：按实际缴纳增值税的税额计算缴纳。适用费率教育费附加为3%；地方教育附加2%。d、印花税：（1）财产租赁合同、仓储保管合同、财产保险合同，适用税率为千分之一；（2）加工承揽合同、建设工程勘察设计合同、货运运输合同、产权转移书据，税率为万分之五；（3）购销合同、建筑安装工程承包合同、技术合同，税率为万分之三；（4）借款合同，税率为万分之零点五；（5）对记录资金的帐薄，按“实收资本”和“资金公积”总额的万分之五贴花；（6）营业帐薄、权利、许可证照，按件定额贴花五元。e、企业所得税：适用税率25%（如果是高新技术企业适用税率15%）。f、房产税：有从价计征（税率为1.2％）和从租计征（税率为12％和4％）两种方式。（1）房产税依照房产原值一次减除10%至30%后的余值计算缴纳。具体减除幅度，由省、自治区、直辖市人民政府规定，税率1.2%。其中：自用的地下建筑，按以下方式计税：（财税[2005]181号）a、工业用途房产，以房屋原价的50%～60%作为应税房产原值。应纳房产税的税额=应税房产原值×[1-（10%-30%）]×1.2%b、商业和其他用途房产，以房屋原价的70%～80%作为应税房产原值。应纳房产税的税额=应税房产原值×[1-（10%-30%）]×1.2%c、对于与地上房屋相连的地下建筑，如房屋的地下室、地下停车场、商场的地下部分等，应将地下部分与地上房屋视为一个整体按照地上房屋建筑的有关规定计算征收房产税。（2）房产出租的，以房产租金收入为房产税的计税依据，计征房产税的租金收入不含增值税，税率12%。对个人出租住房，按4%的税率征收房产税。（财税〔2008〕24号）g、个人所得税：依据个人所得税法规定计算缴纳。h、土地使用税等各地有各自的规定（请询当地地税局）。
营改增后，建筑工程企业要缴纳的税有：
1、执行一般计税法的企业增值税税率11%；
2、一般纳税人执行简易计税法和小规模纳税人企业增值税税率3%。
3、其他附加税种如：城建税=增值税额×税率。税率市区7%；县城、镇5%；乡村1%。 教育费附加=增值税额×3%。 地方教育附加=（增值税+消费税+营业税）×2%。 上述在地税局申报缴纳附加税依据应交增值税税额计征。还有其他企业所得税、车船使用税、房产税依旧缴纳。
扩展资料
营业税改增值税，简称营改增，是指以前缴纳营业税的应税项目改成缴纳增值税。营改增的最大特点是减少重复征税，可以促使社会形成更好的良性循环，有利于企业降低税负。
增值税只对产品或者服务的增值部分纳税，减少了重复纳税的环节，是党中央、国务院，根据经济社会发展新形势，从深化改革的总体部署出发做出的重要决策。目的是加快财税体制改革、进一步减轻企业赋税，调动各方积极性，促进服务业尤其是科技等高端服务业的发展，促进产业和消费升级、培育新动能、深化供给侧结构性改革。
参考资料营改增_百度百科
