1. 日本公司税务变更流程
您可以在申报窗口期选择补税或在税局要求情况下主动配合进行补缴。
以目前日本国税厅的人力及方向情况来看，日本税务机构暂时不会进行主动查税。
还是比较建议您优先申请JCT的，因为可以保障不会受到发票新规和平台政策影响而导致店铺订单流失。
而且目前看来注册JCT，反而会提升以企业采购为目的的订单竞争力，符合店铺的利益。
2. 日本公司缴税
营业税； 按实际缴纳的营业税计交城建税和教育附加及其他各种地方附加税；
①合伙制的会计事务所要缴纳个人所得税；
②公司制的会计事务所要缴纳企业所得税； 审计业务的合同不需要缴纳印花税，但相关的账本要按规定缴纳印花税； 如自行拥有房产和土地使用权，则要按规定缴纳房产税和土地使用税。 至于其他税种是否需要缴纳，视有无应税业务或应税行为（或财产）。 会计师事务所 会计师事务所（Accounting Firms）是指依法独立承担注册会计师业务的中介服务机构，是由有一定会计专业水平、经考核取得证书的会计师（如中国的注册会计师、美国的执业会计师、英国的特许会计师、日本的公认会计师等）组成的、受当事人委托承办有关审计、会计、咨询、税务等方面业务的组织。中国对从事证券相关业务的会计师事务所和注册会计师实行许可证管理制度。
3. 日本公司税种
日本农村也有房产税
一、日本农村住宅相关税
日本的不动产是由土地和建筑物构成的，所以都要交税。农村的住宅、农田和山林也要交税。
不动产的主要税金是固定资产税，即拥有土地和建筑物的税，每年都会征收。其次是不动产取得税，也就是购买土地和建筑时缴纳的税，这两个税都 是 地 方 税(缴 纳 给 市 町 村 政 府 的税)。
二、关于日本的不动产税
在日本，所有的不动产都要交税，但是根据地区的不同，税率有很大差异，例如土地分为住宅地、农田、工业用地等，非常复杂。农田的税非常低，这是为了保护农业和农田。但是，农田只能用于种植，如果变为建设住宅的宅基地，需要履行非常复杂的手术。
日本的不动产的税金计算方法非常复杂，是为了保护农田，确保城市建设的财源、保护绿地和培育产业等，例如通过下调税率支持企业的活动。作为投资目的，也有人购买不动产，如果是优良不动产，可以通过出租获得租金，或者转卖获得利益。高级住宅区和东京都中心地区，比如惠比寿和白金台等，由于土地非常昂贵，所以在这里拥有不动产是一个很大的负担，如果收入足够交税还没问题，但是没有收入，就无法纳税，因此也有失业者不得不出售不动产的情况。
一般说来，土地面积越大，金额越高，税金就越高；同理，房屋建筑面积大、造价高的，税金也高。另外，各种和固定资产有关的税金，凡是自用住房和小户型的，基本上都能够享有一定程度的优惠。上述中固定资产取得税、固定资产税、城市计划税和居民税属于地方税，其余的都是国税。
三、对于税制的影响及背景
1、目前的日本人，基本上都经历过了房产泡沫破灭带来的冲击，刻骨铭心，轻易不会再次在不动产上过于疯狂；
2、金融机构和政府相关部门接受教训，也轻易不会在容易引发不动产热的政策方面开闸放水；
3、日本人口老龄化，出生率又不断降低，刚性需求弱，客观上不具备再次掀起不动产热；
4、长期以来日本经济低迷，人工成本又高，致使不少日本企业将生产转移到国外，也是日本土地、建筑不振的原因之一。
参考
日本的“房产税”新华社——经济参考网
http://dz.jjckb.cn/www/pages/webpage2009/html/2013-06/13/content_75928.htm
4. 日本公司报税时间
不靠谱，在日本即便是“临时工”，收入到了纳税标准，也是应该报税的。
另外，注意“赴日劳务”人员的签证是“研修”，也就是在日的身份是“研修生”，所取得的是“最低生活补贴”而非“工资“，所以，不在纳税话题里。
如果是持“工作签证”赴日工作，在日的就职单位有义务代理个人申报和缴纳“个人所得税”。如果，没有报税则属于“不法经营”“偷税漏税”。
5. 日本公司税务变更流程及手续
可以。退休后可以去日本投资经营。因为你退休后就是自由人了，和你原单位没有关系了，
比如你原来是公务员或者是金融单位上班，他们会给你好多限制，其中一条就是不能做生意，不能在其他单位兼职等，退休了这些限制都解除了，恢复自由身了，愿干啥干啥。
退休（retire），是指根据国家有关规定，劳动者因年老或因工、因病致残，完全丧失劳动能力（或部分丧失劳动能力）而退出工作岗位。2011年1月起，我国对个人提前退休取得的一次性补贴收入，按照“工资、薪金所得”项目征收个人所得税。政府有关方面不断释放出延龄退休的政策意向，民意调查显示，过半受访者反对延长退休年龄，多数主张按规定年龄退休。
