如果是公司制企业，那么，企业要给员工代收代缴个人所得税。
步骤如下：
第一步，给新员工做信息采集。
登录自然人电子税务局客户端，双击 APP，
双击APP以后，跳出以下登录界面：
点击申报密码登录，
输入公司名称，公司统一信用代码（也就是纳税人识别号），以及申报密码。
然后点击登录，进入以下界面：
点击“人员信息采集”，进入以下界面：
若是单个添加的话，首先点击“境内人员”或“境外人员”，然后再点击“添加”，进入以下界面：
填写新员工信息，带“*”为必填项。填写好以后，点击“保存”
接下来，勾选新采集好的员工信息，点击“报送”菜单，等待税务局的反馈信息。
如果新增员工的信息“报送”以后，身份验证状态为“验证通过”，则说明，新员工信息采集成功。
若身份验证状态为“不通过”，那么就要去检查哪些信息没有填写，或者填写信息不符合要求，去修改好以后，再点击保存，然后，再次勾选新员工信息，点击“报送”，再次等待税务局的信息反馈。一直到“验证通过”为止。
第二大步骤：企业作为扣缴义务人，每月给员工工资，薪金所得进行个人所得税的纳税申报。
通过自然人电子税务局客户端输入公司名称，纳税人识别号，以及个税申报密码以后，进入纳税申报系统首页，左侧是代扣代缴菜单，请看下图：
员工工资，薪金所得是属于综合所得申报，所以，点击菜单“综合所得申报”，进去进行纳税申报表的填写！进入界面，如下图：
点击“正常工资，薪金所得”，进去填写纳税申报表。纳税申报表填写完以后，继续第2步，税款计算。计算好税款以后，第3步，附表填写。如果附表没有要填写的内容，那么可以直接跳过，或者点开保存。然后就是第4步，“申报表报送”。
点击完“申报表报送”以后，进入以下界面，如下图：
点击右上角“发送申报”，然后等税务局的反馈信息，反馈信息看“申报状态”，如果成功会显示“成功申报无须缴款”或“成功申报，需要缴款”
若需要缴款，则返回主页左边菜单栏位，找到“税款缴纳”，点击“税款缴纳”进去缴纳税款。
若是签订了三方协议（公司，银行，税务局签订三方协议），那么点击“三方协议缴税”进去。
点击“三方协议缴税”进去以后，点击“立即缴款”，税款则会自动从公司公账上扣除！
如果是非公司制企业，比如个体工商户，个人独资企业，合伙企业的经营所得交的是个人所得税，不是企业所得税。填写的纳税申报表又是不一样的。
这里由于文章篇幅问题，不再详细讲解。
最后，附上企业员工个人所得税纳税申报视频：
第一集：新员工信息采集
第二集：添加不了，可以去我的头条号找！