依次回答：1、征收方式是企业申请税务核定：企业填报《企业所得税征收方式核定表》，此表可以从主管税务机关领，也可以从税务总局网上下载。如果企业能准确核算利润并按税法规定申报，就核实，如果不能达到税务规定的核算要求，其利润不能核实，就实行核定征收。2、预缴按月还是按季，由税务机关通知，一般情况下是大企业按月小企业按季。3、总分机构的所得税，总局有文件（国家税务总局关于印发《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理暂行办法》的通知国税发[2008]28号），具体情况要问当地主管税务机关，根据企业是跨省跨市或跨县的情况，各省税务部门可以作出具体规定，但有一点是确定的：汇算清缴由法人企业总机构申报。4、企业所得税第54条第二款“企业应当自年度终了之日起五个月内，向税务机关报送年度企业所得税纳税申报表，并汇算清缴，结清应缴应退税款”，企业可以书面申请退税，但一般情况下，由于还要预缴第二年度的税款，也可以抵顶，这样手续简便些。
纳税人按季度申报纳税，年终办理汇算清缴。纳税人于每季度终了后十五日内向主管税务机关办理纳税申报，并提交以下纳税申报资料： 1、企业所得税（季度）纳税申报表或外商投资及外国企业所得税（季度）纳税申报表； 2、财务报表。 以上纳税申报资料各一式三份，主管税务机关对纳税申报资料的完整性审核后签收，将申报数据录入电脑，在申报表上加盖“征收章”。同时将纳税申报资料退还一份给纳税人
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